Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC90BQ9GZT6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC90BQ9GZT6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC90BQ9GZT6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 867.2 ms