Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A8Q9C0K1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC39A8Q9C0K1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A8Q9C0K1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A8Q9C0K1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms