Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SETD2Q9BYW2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SETD2Q9BYW2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SETD2Q9BYW2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SETD2Q9BYW2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms