Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP1-5Q9BYS1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KRTAP1-5Q9BYS1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms