Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEC11CQ9BY50 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEC11CQ9BY50 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC11CQ9BY50 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEC11CQ9BY50 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC11CQ9BY50 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC11CQ9BY50 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC11CQ9BY50 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC11CQ9BY50 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC11CQ9BY50 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC11CQ9BY50 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEC11CQ9BY50 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms