Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFAF3Q9BU61 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms