Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAGR1Q9BTK6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PAGR1Q9BTK6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAGR1Q9BTK6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAGR1Q9BTK6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms