Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RBM42Q9BTD8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
RBM42Q9BTD8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RBM42Q9BTD8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RBM42Q9BTD8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
RBM42Q9BTD8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RBM42Q9BTD8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RBM42Q9BTD8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
RBM42Q9BTD8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RBM42Q9BTD8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RBM42Q9BTD8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms