Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTA3Q9BTC8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MTA3Q9BTC8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MTA3Q9BTC8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms