Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR0

ZKSCAN3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3Q9BRR0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ZKSCAN3Q9BRR0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZKSCAN3Q9BRR0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZKSCAN3Q9BRR0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZKSCAN3Q9BRR0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms