Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYT3Q9BQG1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT3Q9BQG1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYT3Q9BQG1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT3Q9BQG1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms