Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPS8Q99627 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS8Q99627 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS8Q99627 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms