Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDCA3Q99618 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDCA3Q99618 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDCA3Q99618 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA3Q99618 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms