Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDNQ99608 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDNQ99608 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDNQ99608 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDNQ99608 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDNQ99608 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDNQ99608 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDNQ99608 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NDNQ99608 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDNQ99608 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDNQ99608 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDNQ99608 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDNQ99608 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDNQ99608 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDNQ99608 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDNQ99608 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDNQ99608 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDNQ99608 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDNQ99608 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDNQ99608 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDNQ99608 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDNQ99608 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDNQ99608 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDNQ99608 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDNQ99608 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDNQ99608 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDNQ99608 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDNQ99608 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDNQ99608 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDNQ99608 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDNQ99608 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDNQ99608 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDNQ99608 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDNQ99608 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDNQ99608 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDNQ99608 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDNQ99608 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDNQ99608 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDNQ99608 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDNQ99608 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDNQ99608 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDNQ99608 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDNQ99608 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDNQ99608 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDNQ99608 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDNQ99608 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDNQ99608 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDNQ99608 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDNQ99608 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDNQ99608 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDNQ99608 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NDNQ99608 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NDNQ99608 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDNQ99608 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDNQ99608 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDNQ99608 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDNQ99608 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDNQ99608 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDNQ99608 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDNQ99608 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDNQ99608 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDNQ99608 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDNQ99608 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDNQ99608 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDNQ99608 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDNQ99608 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDNQ99608 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDNQ99608 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDNQ99608 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDNQ99608 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDNQ99608 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDNQ99608 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDNQ99608 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDNQ99608 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDNQ99608 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDNQ99608 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDNQ99608 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDNQ99608 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDNQ99608 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDNQ99608 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDNQ99608 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDNQ99608 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDNQ99608 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDNQ99608 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NDNQ99608 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDNQ99608 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDNQ99608 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDNQ99608 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDNQ99608 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDNQ99608 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDNQ99608 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDNQ99608 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDNQ99608 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDNQ99608 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDNQ99608 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDNQ99608 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDNQ99608 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDNQ99608 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDNQ99608 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDNQ99608 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms