Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD180Q99467 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD180Q99467 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD180Q99467 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD180Q99467 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD180Q99467 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD180Q99467 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD180Q99467 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD180Q99467 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD180Q99467 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD180Q99467 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD180Q99467 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD180Q99467 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD180Q99467 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD180Q99467 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD180Q99467 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD180Q99467 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD180Q99467 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD180Q99467 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD180Q99467 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD180Q99467 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD180Q99467 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD180Q99467 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD180Q99467 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD180Q99467 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD180Q99467 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD180Q99467 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD180Q99467 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD180Q99467 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD180Q99467 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD180Q99467 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD180Q99467 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD180Q99467 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CD180Q99467 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD180Q99467 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD180Q99467 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD180Q99467 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD180Q99467 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD180Q99467 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD180Q99467 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD180Q99467 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD180Q99467 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD180Q99467 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD180Q99467 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD180Q99467 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD180Q99467 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD180Q99467 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD180Q99467 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD180Q99467 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD180Q99467 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD180Q99467 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD180Q99467 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD180Q99467 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD180Q99467 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD180Q99467 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD180Q99467 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD180Q99467 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD180Q99467 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD180Q99467 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD180Q99467 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD180Q99467 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD180Q99467 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD180Q99467 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD180Q99467 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD180Q99467 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD180Q99467 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD180Q99467 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD180Q99467 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD180Q99467 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD180Q99467 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD180Q99467 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD180Q99467 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD180Q99467 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD180Q99467 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD180Q99467 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD180Q99467 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD180Q99467 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD180Q99467 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD180Q99467 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD180Q99467 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD180Q99467 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD180Q99467 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD180Q99467 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD180Q99467 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD180Q99467 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD180Q99467 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD180Q99467 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD180Q99467 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD180Q99467 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD180Q99467 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD180Q99467 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD180Q99467 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD180Q99467 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD180Q99467 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD180Q99467 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD180Q99467 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD180Q99467 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD180Q99467 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD180Q99467 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD180Q99467 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms