Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF3RQ99062 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSF3RQ99062 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF3RQ99062 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms