Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMF1Q96S06 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMF1Q96S06 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms