Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CITED4Q96RK1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CITED4Q96RK1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CITED4Q96RK1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms