Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLC4A9Q96Q91 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SLC4A9Q96Q91 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SLC4A9Q96Q91 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLC4A9Q96Q91 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms