Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
INPP4AQ96PE3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INPP4AQ96PE3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.55■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.52■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.52■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INPP4AQ96PE3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms