Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PGLYRP2Q96PD5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PGLYRP2Q96PD5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGLYRP2Q96PD5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PGLYRP2Q96PD5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms