Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ9

PRAP1, Proline-rich acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAP1Q96NZ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRAP1Q96NZ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAP1Q96NZ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAP1Q96NZ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAP1Q96NZ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAP1Q96NZ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAP1Q96NZ9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAP1Q96NZ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAP1Q96NZ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms