Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE2Q96MF7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms