Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX27Q96L92 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX27Q96L92 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms