Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CABS1Q96KC9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABS1Q96KC9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CABS1Q96KC9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms