Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK5RAP3Q96JB5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK5RAP3Q96JB5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK5RAP3Q96JB5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK5RAP3Q96JB5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms