Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms