Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC22AQ96IW7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22AQ96IW7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC22AQ96IW7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms