Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDXPQ96GD0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDXPQ96GD0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDXPQ96GD0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDXPQ96GD0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms