Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BICD1Q96G01 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BICD1Q96G01 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BICD1Q96G01 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms