Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A6EQ96DS6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A6EQ96DS6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A6EQ96DS6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms