Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C18orf8Q96DM3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C18orf8Q96DM3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms