Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUB2Q96DC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTUB2Q96DC9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTUB2Q96DC9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTUB2Q96DC9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
OTUB2Q96DC9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTUB2Q96DC9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTUB2Q96DC9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTUB2Q96DC9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms