Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
REPS1Q96D71 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
REPS1Q96D71 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
REPS1Q96D71 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REPS1Q96D71 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms