Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ROPN1LQ96C74 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ROPN1LQ96C74 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms