Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP6V1E2Q96A05 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms