Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKD2Q969F2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NKD2Q969F2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKD2Q969F2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKD2Q969F2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NKD2Q969F2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms