Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAMP4Q969E2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAMP4Q969E2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAMP4Q969E2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAMP4Q969E2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms