Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BHMTQ93088 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BHMTQ93088 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHMTQ93088 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms