Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDEM1Q92611 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDEM1Q92611 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EDEM1Q92611 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDEM1Q92611 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms