Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF3Q92576 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF3Q92576 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHF3Q92576 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms