Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RGP1Q92546 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RGP1Q92546 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGP1Q92546 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms