Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSPC1Q8WXF1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PSPC1Q8WXF1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSPC1Q8WXF1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSPC1Q8WXF1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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