Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW32

HMGB4, High mobility group protein B4, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB4Q8WW32 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB4Q8WW32 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB4Q8WW32 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB4Q8WW32 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms