Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
TRIM41Q8WV44 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
TRIM41Q8WV44 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
TRIM41Q8WV44 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
TRIM41Q8WV44 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC42.04■■■■■ 4.32
TRIM41Q8WV44 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
TRIM41Q8WV44 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
TRIM41Q8WV44 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
TRIM41Q8WV44 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
TRIM41Q8WV44 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
TRIM41Q8WV44 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
TRIM41Q8WV44 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TRIM41Q8WV44 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
TRIM41Q8WV44 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
TRIM41Q8WV44 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
TRIM41Q8WV44 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
TRIM41Q8WV44 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
TRIM41Q8WV44 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
TRIM41Q8WV44 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
TRIM41Q8WV44 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TRIM41Q8WV44 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TRIM41Q8WV44 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
TRIM41Q8WV44 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
TRIM41Q8WV44 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
TRIM41Q8WV44 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC41.84■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC41.84■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
TRIM41Q8WV44 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms