Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC110Q8TBZ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC110Q8TBZ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC110Q8TBZ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms