Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00301Q8NCQ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LINC00301Q8NCQ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC00301Q8NCQ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00301Q8NCQ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms