Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC29Q8NA56 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC29Q8NA56 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms