Protein–RNA interactions for Protein: Q8N816

TMEM99, Transmembrane protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM99Q8N816 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM99Q8N816 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM99Q8N816 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM99Q8N816 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM99Q8N816 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156 ms