Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC17Q8N6Y2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 325.6 ms